Електрофорезата со гел може да се спроведе или во хоризонтална или вертикална ориентација. Хоризонталните гелови обично се составени од агарозна матрица. Големините на порите на овие гелови зависат од концентрацијата на хемиските компоненти: порите на гелот од агароза (дијаметар од 100 до 500 nm) се поголеми и помалку униформни во споредба со оние на гелпорите на акриламид (од 10 до 200 nm во дијаметар). Споредбено, молекулите на ДНК и РНК се поголеми од линеарната нишка на протеин, кои често се денатурираат пред или за време на овој процес, што ги прави полесни за анализа. Така, молекулите на ДНК и РНК почесто се користат на гелови од агароз (хоризонтално). Нашиот систем DYCP-31DN е хоризонтален систем за електрофореза. Овој уред за лиење гел може да направи 4 различни големини на гелови со различни фиоки за гел.
